MNE-Python 8

Pythonで脳を研究する 8

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引き続きPython MNEで色々と試している.

今回は右半球のパーセレーション（解剖学的領域分割情報） のプロットのサンプルコードを出してみた．

pip install pyvistaqt ipywidgets
pip install qtpy PyQt5
pip install nibabel

import mne

# サンプルデータのパスを取得
sample_data_folder = mne.datasets.sample.data_path()
subjects_dir = sample_data_folder / "subjects"

# Brainクラスを取得（PySurferのラッパー）
Brain = mne.viz.get_brain_class()

# 被験者 "sample" の左半球の pial 表面を表示
brain = Brain("sample", hemi="rh", surf="pial", subjects_dir=str(subjects_dir), size=(800, 600))

# "aparc.a2009s" というパーセレーション（解剖学的領域分割情報）をオーバーレイ
brain.add_annotation("aparc.a2009s", borders=False)

参考文献

• https://mne.tools/stable/index.html
• Destrieux, C., Fischl, B., Dale, A., & Halgren, E. (2010). Automatic parcellation of human cortical gyri and sulci using standard anatomical nomenclature. NeuroImage, 53(1), 1–15. https://doi.org/10.1016/j.neuroimage.2010.06.010